一、概念的区别
1、休学是指因病或事或其它原因暂时停止上学，学籍还保存在该学校。休学期满后返校继续学习。
2、保留学籍是指正式获得学籍的学生因故中断学习但又不符合休学条件，经学校批准后所保留的学习资格。
二、可享受待遇的区别
1、因病休学的学生病休期间享受公费治疗一年，连续病休，第二年停止公费医疗，医疗费自理。停学期间保留学籍，不交学费，不计入在校学习年限，不享受在校学生待遇，学校不安排住宿。
2、保留学籍期间不享受在校生和休学待遇，不得报考其他学校。保留入学资格并不是对新生的一种处分，而是党和国家对青年学生爱护、关怀的一种具体政策体现。
三、时间的区别
1、休学期限一般为一年，休学到半年或未满一年需提前复学，经校长同意后上报辖区教育行政部门审核后，方可复学。复学时由家长持市级以上诊断证明及家长书面申请书上交学校，经校长同意后，学籍管理人员报到上级部门具体办理，方可复学，复学后编入下一年级学习。
2、保留学籍以一年为限，期满可向学校申请复学。
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